一、跨境巴士:大桥开通首年安排粤港、港澳跨境巴士配额共200个,另有200个配额给现在行走其他口岸的粤港跨境巴士转走大桥。每一配额可于每日营运来回班次各一次。跨境巴士在大桥口岸区域内不允许接载新的旅客。
二、穿梭巴士:为主要交通工具,繁忙时间为每5分钟一班,非繁忙时间每10至15分钟一班,深夜时段每15至30分钟一班。穿梭巴士不受配额限制。
三、跨境出租车:大桥开通首三年安排粤港、港澳跨境出租车配额共250个。其中,粤港配额150个,港澳配额100个。每一配额可营运一辆跨境出租车,每日往来接送次数不限。
四、货运车辆:现在粤港跨境货车可以免办手续通过港珠澳大桥(但不包括往来福田保税区的货车)。
五、跨境私家车:在粤港私家车方面,在大桥开通前发出的香港两地牌私家车及大陆私家车配额分别为约1万个和约1000个。此外,粤港政府也会在稍后适当时间,宣布允许目前持有配额使用其他口岸的粤港两地牌跨境私家车,免手续试用大桥的细节安排。
在港澳跨境私家车方面,香港及澳门跨境私家车配额分别为300个(有效期为三年)及600个(有效期为一年),持配额的私家车可于有效期内多次进出港澳市区。此外,符合资格的香港私家车车主可通过“港珠澳大桥澳门口岸泊车转乘计划”,驾驶香港私家车前往澳门口岸边检大楼东停车场停泊,办理入境手续后,于澳门口岸转乘其他交通工具前往澳门市区。
收费:
七座以下私家车、出租车收费标准150元(人民币,下同,30新元)每车次;过境巴士200元每车次;普通货车60元每车次;货柜车115元每车次。
