尽管我国希望及早获得疫苗，评估候选疫苗的安全性仍是首要考量。一般在接种两剂疫苗后，会出现发烧、注射部位疼痛等不适，但这些其实是免疫反应带来的副作用，并不代表疫苗是不安全的。
薛寒友解释，疫苗的安全性和耐受性（tolerability）之间有明显差别。“安全性关乎对个人造成实际伤害的事情，但耐受性是你可能有轻微发烧或头痛，吃了药隔天就好了……有些人会产生这些副作用，但这并不影响整体疫苗的安全性。”
陈世民说，从在动物到在人体上进行试验，并逐渐扩大规模，疫苗的研发全程经过多重安全检查，各个环节须严格遵守安全要求，这给予很大程度的保障。
“没有任何一项研究是万无一失的……重要的是落实有关机制，发生状况时能按照标准作业程序采取行动，保护病患和之后接种疫苗的人。”
除了安全性和耐受性，薛寒友说，专家团也会综合考虑其他因素，包括根据逐步公开的试验结果，评估候选疫苗的有效性，以及我国是否能及早获得该款疫苗等。“例如有些疫苗已经被其他地区大规模采购，因此我们会研究多个因素，才决定向政府建议采购哪款疫苗。”
在这之上，监管本地药物的卫生科学局拥有独立的审查机制。辉瑞疫苗日前已通过该局彻底和严谨的审核，并在大流行病特别采用程序（Pandemic Special Access Route）下获得临时批准。若有最新数据显示这款疫苗的风险大于益处，卫生科学局可随时终止临时批准。
由于辉瑞疫苗和莫德纳疫苗采用的信使核糖核酸（mRNA）是新技术，日前有人谣传疫苗注射到人体后，会改变人体基因。
薛寒友澄清这是不可能的，这项技术无法改变人体基因，而且注射的mRNA疫苗很快就会被人体细胞吸收，并在48个小时内消失，因此不会留下长期作用。
