国民党主席吴敦义在管制期结束后将赴中国大陆，外传去年他曾向台湾总统府申请赴中国大陆出席国共论坛并遭拒。台总统府表示，吴敦义卸任副总统迄今，从未向总统府提出前往大陆的申请。
据中时电子报消息，总统府表示，对于报道指吴敦义曾申请赴大陆遭拒，这是一项未经查证的不实信息。吴敦义卸任副总统迄今，从未向原服务单位（总统府）提出前往大陆申请，更没有因此“拒不放行”等捏造情节。
总统府表示，按照现行法律规定，目前总统府涉密管制人员的出境申请，都依《国家机密保护法》、《总统府办理涉及国家机密人员出境管制作业规定》办理，府方在接获相关申请时，会就这项申请的访问地点、当事人涉、守密程度与机密保护的相关风险，例如申请人的安全等等，是否都在可以保障的范围内，来做整体的评估和准驳。